Java Applet和Java Application在結構方面的主要區別表現在：
（1）運行方式不同。Java Applet程序不能單獨運行，它必須依附于一個用HTML語言編寫的網頁并嵌入其中，通過與Java兼容的瀏覽器來控制執行。 Java Application是完整的程序，可以獨立運行，只要有支持Java的虛擬機，它就可以獨立運行而不需要其他文件的支持。
（2）運行工具不同。運行Java Applet程序的解釋器不是獨立的軟件，而是嵌在瀏覽器中作為瀏覽器軟件的一部分。Java Application程序被編譯以后，用普通的Java 解釋器就可以使其邊解釋邊執行，而Java Applet必須通過網絡瀏覽器或者Applet觀察器才能執行。
（3）程序結構不同。每個Java Application程序必定含有一個并且只有一個main方法，程序執行時，首先尋找main方法，并以此為入口 點開始運行。含有main方法的那個類，常被稱為主類，也就是說，Java Application程序都含有一個主類。而Applet程序則沒有含 main方法的主類，這也正是Applet程序不能獨立運行的原因。盡管Applet沒有含main方法的主類，但Applet一定有一個 從 java.applet.Applet派生的類，它是由Java系統提供的。
（4）Java Applet程序可以直接利用瀏覽器或AppletViewer提供的圖形用戶界面，而Java Application程序則必須另外書寫專用代碼來營建自己的圖形界面。
（5）受到的限制不同Java Application程序可以設計成能進行各種操作的程序，包括讀／寫文件的操作，但是 Java Applet 對站 點的磁盤文件既不能進行讀操作，也不能進行寫 操作。然而，由于 Applet的引入，使Web頁面具有動態多媒體效果和可交互性能，這使由名為超文本、實為純文本的HTML語言編寫成的Web頁面真正具有了超文本功 能，不但可以顯示文本信息，而且還可以有各種圖片效果和動態圖形效果，從而使頁面顯得生動美麗；另外，Applet使Web頁面增加了按鈕等功能，從而增 加了交互性。