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一、bsub
bsub,提交給lsf作業的命令。
命令格式
       bsub  [options]   command   [argument]
       bsub   -pack  job_submission_file
 
-q    選擇隊列
-i     指定輸入文件  
-I      交互模式,此時終端不能輸入
-o     指定輸出文件,作業提交后標準輸出的信息會保存到這個文件中。
-e     指定輸出文件,作業提交后標準錯誤輸出的信息會保存到這個文件中。
-n     指定作業需要的CPU核
-J     作業的名字
-w  ‘dependecy_expression’  , 提交作業前,指定操作。
              操作有: done  
                             ended, 如 –e “ended(aaaa*)” , 表示作業名中有aaaa的作業,完成之后才可以提交作業
                             exit
-W    限定作業運行時間
-K     提交作業,并且等待作業完成。當提交作業后,終端打印“waiting for dispath”。當作業完成后,終端打印“job is finished”。作業沒有完成,不能提交新的作業。
 
%J,可表示作業號
       LSF(load sharing facility)是分布資源管理的工具,用來調度、監視、分析聯網計算機的負載。
目的:
       通過集中監控和調用,充分共享計算機的CPU、內存、磁盤、license等資源
 
       一組安裝了LSF軟件的計算機組成了一個cluster。cluster內的資源統一監控和調度。
       server host:cluster內提交和執行job的計算機
       client host:cluster內僅僅提交job的計算機
JOB
–提交給LSF的命令
-LSF負責調度、控制、跟蹤job
 
命令
l  bjobs :查看系統的job
l  bsub:提交作業
l  bhist:查看作業歷史
l  bkill: kill一個作業
 
bqueues命令,可以查看隊列情況
參數
解釋
QUEUE_NAME
隊列的名字
PRIO
隊列的優先級,數字越大,優先級越高
STATUS
狀態
Open:Active :  表示已激活,可使用
Closed:Active: 表示已關閉,不可使用
MAX
隊列對應的最大CPU核數
l  表示無限
JL/U
單個用戶同時可以使用的CPU核數
NJOBS
排隊、運行和被掛起的總作業所占CPU核數
PEND
排隊中的作用所需CPU核數
RUN
運行中的作業所占CPU核數
SUSP
被掛起的作業所占CPU核數
 
bsub提交的作業,有一個JOBID和JOB_NAME。JOBID不可設置,JOB_NAME可以設置。
bsub命令的 –J 參數,可以指定 JOB_NAME。
二、例子
       一個c程序,如下所示:
       編譯生成a.out可執行文件,然后將該文件通過bsub提交,執行。
 
       通過busb命令,將該a.out可執行文件,提交8次作業。-J參數,執行作業的名字。-o參數指定lsf執行該可執行文件的輸出,保存到指定文件。
       最后要等待這些作業完成,通過以下bsub命令。
              bsub –I –w “ended(aaaaaaaaaa*)”  echo “a.out finished”
       提交一個作業,只是打印信息:
l  -I參數,表示和終端交互,后續提交的任務要等這個任務完成后,才可以提交
l  -w ”ended..” 指定該作業要等作業名中有aaaaaaaa的作業都完成后,才可以提交。
       執行這些命令的打印信息。每個任務有一個JOB_ID。
       執行的過程中,通過bjobs 命令,可以查看作業情況。對于最后一個任務,狀態是PEND的,因此要等之前的任務都完成之后,才可以執行。
posted on 2021-10-05 01:52 小王 閱讀(3909) 評論(0)  編輯 收藏 引用 所屬分類: linux
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