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通常我們大量使用array of structure來開發程序,因為array of structure 具有面向對象的特征,易于描述客觀世界,代碼也容易理解。但是 array of structure 卻常常會阻礙程序的并行化。
structure of array 與之相反,它易于并行化,但拙于描述客觀世界,代碼也變得難以理解。 
要想代碼性能好就要使用structure of array , 要想開發效率高就要使用array of structure, 設計之初就要做出選擇,開發后期如果想轉換到另一種方案將會大費周章。 
 Intel 的 Array building block 提供了一套編程接口 讓我們可以從array of structure 的視角編寫基于 structure of array的程序。這話說起來有點繞,可以這樣理解,在邏輯層是array of structure , 在物理層是structrue of array. 
在C++中我們如何實現這種邏輯層(array of structure )/物理層(structrue of array )的分離與映射呢?
這是我們基于array of structure 的程序
struct RGB
{
        int r;
        int g;
        int b;
};
template<class T>
void test(T& rgb, size_t n)
{
    int i =0;
    for(i=0;i<SIZE;i++){
        rgb[i].r = 3*i;
        rgb[i].g = 3*i + 1;
        rgb[i].b = 3*i + 2;
    }
    for(i=0;i<SIZE;i++){
        rgb[i].b=rgb[i].r + rgb[i].g;
    }

#define SIZE 65536
int main()
{
  RGB* rgb = new RGB[SIZE];
  test(rgb, SIZE);
}

要將上面的程序轉換為SOA,我們首先為RGB定義一個影子
struct RGBshadow
{
        RGBshadow(int& r, int& g, int& b):r(r),g(g),b(b){}
        int& r;
        int& g;
        int& b;
};

然后我們有一個模板類用于定義SOA類,此類為通用類
template<class Shadow, typename T1, typename T2, typename T3>
class SOA
{
    public:
        typedef T1 aligned_t1 __attribute__((aligned(16)));
        typedef T2 aligned_t2 __attribute__((aligned(16)));
        typedef T3 aligned_t3 __attribute__((aligned(16)));
    public:
        SOA(int n){
            r = (aligned_t1*)_mm_malloc(n*sizeof(T1), 64);
            g = (aligned_t2*)_mm_malloc(n*sizeof(T2), 64);
            b = (aligned_t3*)_mm_malloc(n*sizeof(T3), 64);
        }
        ~SOA(){
            if(r) _mm_free(r);
            if(g) _mm_free(g);
            if(b) _mm_free(b);
        }
        Shadow operator [] ( size_t i){
            return Shadow(r[i],g[i],b[i]);
        }
    private:
        aligned_t1* r ;
        aligned_t2* g ;
        aligned_t3* b ;
};

#define SIZE 65536
int main()
{
  RGB* rgb = new RGB[SIZE];
  test(rgb, SIZE);
  SOA<RGBshadow, intint,int> soa(SIZE);
  test(soa, SIZE);
}
編譯器會自動向量化test(soa,SIZE);
test(rgb, SIZE);中的第二個for循環生成的代碼如下:
.L14:
    movl    (
%rbx,%rax), %edx
    addl    
4(%rbx,%rax), %edx
    movl    
%edx, 8(%rbx,%rax)
    addq    $
12%rax
    cmpq    $
786432%rax
    jne .L14

test(soa, SIZE);中的第二個for循環生成的代碼如下:
.L16:
    movdqa  (
%rsi,%rax), %xmm0
    paddd   (
%rcx,%rax), %xmm0
    movdqa  
%xmm0, (%rdx,%rax)
    addq    $
16%rax
    cmpq    $
262144%rax
    jne .L16

要將AOS轉換為SOA,分如下三步
1。 定義一個影子結構
2。 利用SOA<shadow,...>模板定義相應的SOA結構
3。 修改業務代碼,SOA<shadow,...> 與AOS有相同的操作方式,因而可以盡量少的修改代碼。


Feedback

# re: 并行化你的程序--Array of structure 與 structure of Array  回復  更多評論   

2012-08-06 14:14 by ningle
看你的博客,uefi的application基本都是用C++寫成,難道這是現在uefi application開發的主流嘛?

# re: 并行化你的程序--Array of structure 與 structure of Array  回復  更多評論   

2012-08-06 22:16 by djx_zh
@ningle
開發UEFI application的主流還是C。 如果application規模十分龐大,用C++開發效率會高些。
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